 |
REYKJAVIK, Iceland, Nov. 6, 2023 — Sebuah studi komprehensif baru dari deCODE genetics, anak perusahaan Amgen, yang diterbitkan hari ini dalam Nature Genetics, memberikan wawasan tentang epidemiologi dan genetika somatik dan genetika warisan dari hematopoiesis klona. Data genom utuh dari Islandia dan UK Biobank, digabungkan dengan strategi penandaan mutasi somatik unik, digunakan untuk menyelidiki hematopoiesis klona pada skala populasi.
Simon N. Stacey, ilmuwan di deCODE genetics dan penulis pertama pada makalah „Epidemiologi dan Genetika Hematopoiesis Klona, Kondisi Sel Induk Hematopoietik Premalignan“ berbicara dengan Kari Stefánsson CEO deCODE genetics.
Hematopoiesis klona adalah kondisi yang muncul ketika satu garis keturunan klon hematopoietik tunggal (HSC) meluas dan menjadi sumber sebagian besar sel darah dewasa. Para ilmuwan deCODE menggunakan data urutan genom utuh dari lebih dari 176.000 orang untuk mendeteksi hematopoiesis klona pada lebih dari 16.000 subjek. Studi ini menegaskan kembali bahwa hematopoiesis klona sangat umum pada orang tua, mendekati 50% pada orang berusia di atas 80 tahun. Orang dengan hematopoiesis klona memiliki risiko lebih tinggi untuk didiagnosis selanjutnya dengan neoplasia hematologis, dan mereka memiliki tingkat kematian yang lebih tinggi. Sebelumnya diklaim bahwa hematopoiesis klona terlibat dalam spektrum penyakit nonhematologis yang luas, mulai dari karsinoma hingga penyakit kardiovaskular. Studi ini menunjukkan bahwa merokok mempercepat perkembangan hematopoiesis klona secara dosis tergantung dan bahwa semua penyakit nonhematologis terkait kemungkinan terkait dengan perilaku merokok. Studi ini menemukan bukti mutasi yang terjadi pada HSC yang dapat mendorong ekspansi klon mereka. Lebih lanjut, para peneliti menemukan 25 varian urutan warisan yang memengaruhi individu untuk mengembangkan hematopoiesis klona. Para ilmuwan deCODE mengembangkan metode untuk mendeteksi hematopoiesis klona berdasarkan urutan genom utuh. Metode ini bergantung pada fakta bahwa setiap klon membawa “barcode” mutasi unik yang muncul secara somatik selama perkembangan dan hadir pada sel pendiri pada saat insepsi klon. Jika klon HSC tertentu meluas cukup, maka barcode mutasi ini dapat terdeteksi dengan pengurutan dan memberikan indikator bahwa subjek memiliki hematopoiesis klona. Hematopoiesis klona memiliki banyak ciri-ciri ekspansi klon sel prakanker dengan potensi menjadi kanker. Memang, orang dengan hematopoiesis klona berisiko lebih tinggi terhadap neoplasia hematologis dan kematian dini. Meskipun demikian, sementara beberapa kematian lebih lanjut dapat diatribusikan ke neoplasia hematologis, banyak yang dapat diatribusikan ke penyakit terkait merokok. Hematopoiesis klona ditemukan meningkatkan risiko diagnosis tidak hanya neoplasia hematologis, tetapi juga penyakit paru obstruktif kronis, kanker paru-paru, penyakit arteri perifer, emfisema dan penyalahgunaan alkohol. Studi ini tidak, bagaimanapun, menemukan bukti mendukung asosiasi yang luas dilaporkan antara hematopoiesis klona dan penyakit kardiovaskular. Merokok ditemukan memiliki efek dosis tergantung pada hematopoiesis klona dan mungkin mempercepat perkembangannya seiring bertambahnya usia orang. Ini menunjukkan bahwa hematopoiesis klona dalam beberapa hal adalah penanda merokok dan bahwa asosiasi penyakit nonhematologis pada dasarnya adalah akibat perilaku merokok dan usia lanjut. Kemudian studi ini menyelidiki dasar genetik dari hematopoiesis klona, terlebih dahulu berfokus pada mutasi yang mungkin terjadi pada HSC, memberikan keunggulan selektif yang memungkinkan mereka menguasai sumsum tulang dan hematopoiesis. Mereka menemukan beberapa mutan pengemudi tersebut, banyak yang telah diketahui terlibat dalam neoplasia mieloid dan limfoid. Namun, sebagian besar klon HSC tidak memiliki mutan pengemudi yang jelas dan mengapa mereka meluas masih menjadi misteri. Beralih ke varian warisan yang membuat orang rentan terhadap CH, deCODE menemukan gen yang terganggu pada 25 lokus semacam itu. Dalam beberapa kasus, varian-varian tersebut ditunjukkan mempengaruhi ekspresi gen, splicing atau tingkat protein plasma terkait dengan CH. Varian cenderung juga mempengaruhi hitung sel darah, neoplasia mieloproliferatif dan panjang telomere leukosit. Secara keseluruhan, studi ini telah memberikan wawasan mendalam tentang genetika dan epidemiologi hematopoiesis klona.
Berbasis di Reykjavik, Islandia, deCODE adalah pemimpin global dalam menganalisis dan memahami genom manusia. Dengan menggunakan keahlian dan sumber daya populasi yang unik, deCODE telah menemukan faktor risiko genetik untuk puluhan penyakit umum. Tujuan memahami genetika penyakit adalah menggunakan informasi itu untuk menciptakan cara baru diagnosis, pengobatan dan pencegahan penyakit. deCODE adalah anak perusahaan yang sepenuhnya dimiliki Amgen (NASDAQ: AMGN).
Video – http://rssdatabase.tickerwit.com/images/304/16304_2.mp4
Simon N. Stacey, ilmuwan di deCODE genetics dan penulis pertama pada makalah dan Kári Stefánsson CEO deCODE genetics